提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。
全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
辽宁新春戏曲晚会:名段名家齐聚展现中华传统文化******
中新网沈阳2月3日电 (记者 韩宏)“梅花大奖”获得者冯玉萍、“梅花奖”获得者李静文、“牡丹奖”获得者张春丰......3日,名家云集“菊苑流芳—2023辽宁省新春戏曲晚会”,通过戏曲艺术展现辽宁独特的文化传统和社会风貌。
戏曲艺术是中华文化的瑰宝,辽宁戏曲地域特色浓郁,艺术风格鲜明。此次晚会由辽宁省文化和旅游厅、辽宁省公共文化服务中心共同主办,沈阳市文化旅游和广播电视局承办,围绕“庆新春,闹元宵”主题,生动展示辽宁戏曲艺术魅力。
此晚会围绕“庆新春,闹元宵”主题,生动展示辽宁戏曲艺术魅力。 辽宁省文化和旅游厅供图以武戏见长的辽宁京剧,涌现了以唐韵笙(“唐派”)为代表的一批京剧名家,推出了《雁荡山》等一大批优秀剧目,在京剧界享有盛誉。评剧是在中国北方影响广泛的地方戏曲剧种,辽宁评剧产生了以韩少云、花淑兰、筱俊亭为代表的三大艺术流派,创作演出了《小女婿》等一大批优秀剧目,在全国具有广泛影响。本台晚会除演出京剧、评剧经典作品外,还将欣赏到辽宁独有的地方戏曲剧种演出,是辽宁戏曲艺术的一次盛宴。
据了解,这是辽宁省首次举办新春戏曲晚会。本台戏曲晚会全剧种、全辽班,因为是首次举办戏曲晚会,演出的12个节目,涵盖京剧、评剧、辽剧、海城喇叭戏、阜新蒙古剧、凌源影调戏、二人转等目前辽宁省所有的戏曲剧种。参演院团和演员全部来自辽宁,是辽宁省各戏曲剧种的一次集中展示。
晚会现场。 辽宁省文化和旅游厅供图本台晚会汇集了辽宁省著名的戏曲名家,“梅花大奖”获得者冯玉萍、“梅花奖”获得者李静文、常东、周丹、凌珂,“牡丹奖”获得者张春丰,以及京剧唐派,评剧韩派、花派、筱派、新派、白派等优秀传人,名家云集,新人担纲。演出《汉津口》《望江亭》《谢瑶环》《花为媒》《杨门女将》等最具代表性的传统剧目,名段荟萃。
据了解,参演单位来自沈阳、大连、鞍山、锦州、营口、阜新、铁岭、朝阳等8个市的多家戏曲院团,是辽宁省戏曲院团的一次集中亮相。演出实行公益惠民,100元以下惠民票达到50%以上,让更多戏曲观众走进剧场。同时在辽宁文化云平台上直播,让全国观众欣赏,扩大辽宁戏曲影响力。(完)
(文图:赵筱尘 巫邓炎) [责编:天天中] 阅读剩余全文() |