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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

成都高新启动中试跨越行动计划：50亿元平台建设基金打造全国中试首选地******

　　中新网成都1月9日电 (王利文)成都高新区9日下午启动实施中试跨越行动计划，未来五年将设立50亿元中试平台建设基金，建设具有全国影响力的科技成果中试首选地。

　　中试作为科研成果实验室小试和产业化发展之间承上启下的环节，一端连着创新，一端连着产业，是推进科技成果产业化的“转化器”，衔接上下游产业链的“连接器”。中试平台不仅帮助转化，吸引团队，聚集人才和项目，帮助科技成果转化跨越“死亡之谷”，还能赋能产业，提升现有产业能级，孵化未来产业。

　　据了解，为大力支持中试首选地打造，成都高新区从平台建设、项目孵化、人才保障、中试项目、金融资本五个维度推出“中试十条政策”，设立50亿元中试平台建设基金，新建20个中试平台，服务1000个中试项目，实现200个创新产品上市，孵化100家创新型科技企业，建成具有全国影响力的科技成果中试首选地。

　　值得注意的是，该政策覆盖面广、力度大、显示度高，建设中试平台最高可获5000万元支持，重大突破型平台可量身定制支持政策，中试项目最高可获1000万元支持。

　　“这是我们所见到的国内首支专业投向中试平台的基金，该基金联合专业力量一起下深水，聚焦科技创新及科技成果转化的关键环节，专注创新成果和产业化之间‘桥梁’的建设投资和长期陪跑。”中信聚信投资总监吴波表示，此举对提升区域优势产业集群竞争力有重大带动作用，通过基金投资实践，有助于提高中国相关行业公共服务能力、关键共性技术创新能力和产业化水平。

　　当日，成都高新区同步发布首批十个中试平台招引方向，涉及功率半导体、生物医药、医疗器械、车载智能、智能传感芯片、先进陶瓷材料等多个主导产业细分赛道和新兴产业，立项平台最高可获5000万元产业扶持资金，重大产业突破型平台给予量身定制政策支持。

　　“成都高新区中试平台重点是提供制造服务，为制造业赋能，推动实体经济发展。目前，成都高新区已建成中试平台8个，在建4个。”成都高新区科技创新局相关负责人介绍，中试平台招引清单结合产业发展需求策划发布，长期有效。下一步，高新区将深入开展中试平台招引落地工作，集聚中试平台配套的上下游产业链资源，力争建成全国科技成果中试首选地。(完)

　　（文图：赵筱尘 巫邓炎）